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LabMedMolGe - Team

Francesca Rizzo

Francesca Rizzo

e-mail: frizzo@unisa.it

 

Laurea in Chimica, Università degli Studi di Napoli "Federico II" (2002)

 

Master universitario in Bioinformatica, Università del Sannio, Benevento(2003)

 

Dottorato in Genetics, development and differentiation, Open University, Londra (2007)

Socio Fondatore della start-up innovativa Genomix4Life S.r.l., spin-off dell'Università degli Studi di Salerno (www.genomix4life.com)

 

Competenze ed attività di ricerca: Biologia cellulare e molecolare, genomica e bioinformatica. Applicazione di metodiche di microarray e sequenziamento di nuova generazione (NGS) per lo studio di genomi, trascrittomi e modifiche epigenetiche.

 
Abilitazione alla Professione di Chimico, Università degli Studi di Napoli "Federico II" (2003)

 

Borsista nell'ambito del progetto finanziato dalla Fondazione con il Sud: "Formazione di capitale umano di eccellenza nel settore delle biotecnologie applicate alla medicina per l'inserimento nel mondo del lavoro di giovani talenti delle regioni del sud Italia"(2010 - 2011)

 

Borsista Fondazione Umberto Veronesi "Young Investigator Programme" (Gennaio 2013 - Dicembre 2013)

 

Assegnista di ricerca nel progetto "Un approccio integrato per lo studio del carcinoma epatocellulare: dalla patogenesi molecolare alla terapia mirata" (Febbraio 2014-Febbraio 2017).

Ricercatore a tempo determinato (art. 24 c.3-a L. 240/10, SSD MED/04) presso il Dipartimento di Medicina, Chirurgia e Odontoiatria "Scuola Medica Salernitana" dell'Università degli Studi di Salerno (da Maggio 2017 ad oggi)

 

 

Pubblicazioni:

  • Tarallo R, Giurato G, Bruno G, Ravo M, Rizzo F, Salvati A, Ricciardi L, Marchese G, Cordella A, Rocco T, Gigantino V, Pierri B, Cimmino G, Milanesi L, Ambrosino C, Nyman TA, Nassa G, Weisz A. The nuclear receptor ERβ engages AGO2 in regulation of gene transcription, RNA splicing and RISC loading. Genome Biol.2017 Oct 6;18(1):189. doi: 10.1186/s13059-017-1321-0. PubMed PMID: 29017520.
  • Montico B, Lapenta C, Ravo M, Martorelli D, Muraro E, Comaro E, Spada M, Donati S, Santini SM, Tarallo R, Giurato G, Rizzo F, Weisz A, Belardelli F, Dolcetti R, Dal Col J. Exploiting immunogenic cell death to improve dendritic cell-based vaccines for lymphoma immunotherapy. OncoImmunology: e1356964. doi:10.1080/2162402X.2017.1356964
  • Pistore C, Giannoni E, Colangelo T, Rizzo F *, Magnani E, Muccillo L, Giurato G, Mancini M, Rizzo S, Riccardi M, Sahnane N, Del Vescovo V, Kishore K, Mandruzzato M, Macchi F, Pelizzola M, Denti MA, Furlan D, Weisz A, Colantuoni V, Chiarugi P, Bonapace IM.  DNA methylation variations are required for epithelial-to-mesenchymal transition induced by cancer-associated fibroblasts in prostate cancer cells. Oncogene. 2017 Jun 5. doi: 10.1038/onc.2017.159. *Co-first author 
  • Panero R, Rinaldi A, Memoli D, Nassa G, Ravo M, Rizzo F, Tarallo R, Milanesi L, Weisz A, Giurato G. iSmaRT: a toolkit for a comprehensive analysis of small RNA-Seq data. Bioinformatics. 2017 Mar 15;33(6):938-940. doi:10.1093/bioinformatics/btw734. 
  • Rizzo F, Coffman JA, Arnone MI. An Elk transcription factor is required for Runx-dependent survival signaling in the sea urchin embryo. Dev Biol. 2016 Aug 1;416(1):173-186. doi: 10.1016/j.ydbio.2016.05.026. Epub 2016 May 24. 
  • Cuomo D, Porreca I, Cobellis G, Tarallo R, Nassa G, Falco G, Nardone A, Rizzo  F, Mallardo M, Ambrosino C. Carcinogenic risk and Bisphenol A exposure: A focus on molecular aspects in endoderm derived glands. Mol Cell Endocrinol. 2017 Dec 5;457:20-34. doi: 10.1016/j.mce.2017.01.027. 
  • Fiume G, Scialdone A, Rizzo F, De Filippo MR, Laudanna C, Albano F, Golino G, Vecchio E, Pontoriero M, Mimmi S, Ceglia S, Pisano A, Iaccino E, Palmieri C, Paduano S, Viglietto G, Weisz A, Scala G, Quinto I. IBTK Differently Modulates Gene Expression and RNA Splicing in HeLa and K562 Cells. Int J Mol Sci. 2016 Nov 7;17(11). pii: E1848
  • Rizzo F, Rinaldi A, Marchese G, Coviello E, Sellitto A, Cordella A, Giurato G,Nassa G, Ravo M, Tarallo R, Milanesi L, Destro A, Torzilli G, Roncalli M, Di Tommaso L, Weisz A. Specific patterns of PIWI-interacting small noncoding RNA expression in dysplastic liver nodules and hepatocellular carcinoma. Oncotarget. 2016 Aug 23;7(34):54650-54661. doi: 10.18632/oncotarget.10567. 
  • Porta A, Petrone AM, Morello S, Granata I, Rizzo F, Memoli D, Weisz A, Maresca B. Design and expression of peptides with antimicrobial activity against Salmonella typhimurium. Cell Microbiol. 2017 Feb;19(2). doi: 10.1111/cmi.12645.
  • Marchese G, Rizzo F, Guacci A, Weisz A, Coppola G. Kleefstra-variant syndrome with heterozygous mutations in EHMT1 and KCNQ2 genes: a case report. Neurol Sci. 2016 May;37(5):829-31. doi: 10.1007/s10072-016-2482-4. 
  • Rizzo F, Ambrosino P, Guacci A, Chetta M, Marchese G, Rocco T, Soldovieri MV, Manocchio L, Mosca I, Casara G, Vecchi M, Taglialatela M, Coppola G, Weisz A. Characterization of two de novoKCNT1 mutations in children with malignant migrating partial seizures in infancy. Mol Cell Neurosci. 2016 Apr;72:54-63. doi:10.1016/j.mcn.2016.01.004. 
  • Chetta M, Guacci A, Rizzo F,  Operto FF, Weisz A, and Coppola G.  Infantile spasms in early-onset Niemann-Pick disease with a novel compound heterozygous mutations in SMPD1 gene. New Horizons in Translational Medicine. 2015 Sep; 2(6-7):155-158 doi: 10.1016/j.nhtm.2015.11.001.
  • Guacci A, Chetta M, Rizzo F, Marchese G, De Filippo MR, Giurato G, Nassa G, Ravo M, Tarallo R, Rocco T, Operto FF, Weisz A, Coppola G. Phenytoin neurotoxicity in a child carrying new STXBP1 and CYP2C9 gene mutations. Seizure. 2016 Jan;34:26-8. doi: 10.1016/j.seizure.2015.11.004. 
  • Dago DN, Scafoglio C, Rinaldi A, Memoli D, Giurato G, Nassa G, Ravo M, Rizzo F, Tarallo R, Weisz A. Estrogen receptor beta impacts hormone-induced alternative mRNA splicing in breast cancer cells. BMC Genomics. 2015 May 9;16:367. doi:10.1186/s12864-015-1541-1.
  • Cimmino G, Tarallo R, Nassa G, De Filippo MR, Giurato G, Ravo M, Rizzo F, Conte S, Pellegrino G, Cirillo P, Calabro P, Öhman T, Nyman TA, Weisz A, Golino P. Activating stimuli induce platelet microRNA modulation and proteome reorganisation. Thromb Haemost. 2015 Jul;114(1):96-108. doi:10.1160/TH14-09-0726. 
  • Ravo M, Cordella A, Rinaldi A, Bruno G, Alexandrova E, Saggese P, Nassa G, Giurato G, Tarallo R, Marchese G, Rizzo F, Stellato C, Biancardi R, Troisi J, Di Spiezio Sardo A, Zullo F, Weisz A, Guida M. Small non-coding RNA deregulation in endometrial carcinogenesis. Oncotarget. 2015 Mar 10;6(7):4677-91. doi:10.18632/oncotarget.2911
  • Stellato C, Nassa G, Tarallo R, Giurato G, Ravo M, Rizzo F, Marchese G, Alexandrova E, Cordella A, Baumann M, Nyman TA, Weisz A, Ambrosino C. Identification of cytoplasmic proteins interacting with unliganded estrogen receptor α and β in human breast cancer cells. Proteomics. 2015 Jun;15(11):1801-7. doi: 10.1002/pmic.201400404. 
  • Hashim A, Rizzo F, Marchese G, Ravo M, Tarallo R, Nassa G, Giurato G, Santamaria G, Cordella A, Cantarella C, Weisz A. RNA sequencing identifies specific PIWI-interacting small non-coding RNA expression patterns in breast cancer. Oncotarget. 2014 Oct 30;5(20):9901-10. PubMed PMID: 25313140. 
  • Rizzo F, Hashim A, Marchese G, Ravo M, Tarallo R, Nassa G, Giurato G, Rinaldi A, Cordella A, Persico M, Sulas P, Perra A, Ledda-Columbano GM, Columbano A, Weisz A. Timed regulation of P-element-induced wimpy testis interacting RNA expression during rat liver regeneration. Hepatology. 2014 Sep;60(3):798-806. doi: 10.1002/hep.27267. Epub 2014 Jul 1. PubMed PMID: 24930433. 
  • Nassa G, Tarallo R, Giurato G, De Filippo MR, Ravo M, Rizzo F, Stellato C,Ambrosino C, Baumann M, Lietzèn N, Nyman TA, Weisz A. Post-transcriptionalregulation of human breast cancer cell proteome by unliganded estrogen receptor β via microRNAs. Mol Cell Proteomics. 2014 Apr;13(4):1076-90. doi:10.1074/mcp.M113.030403. Epub 2014 Feb 13. PubMed PMID: 24525454; PubMed Central PMCID: PMC3977185.
  • Andrikou C, Iovene E, Rizzo F, Oliveri P, Arnone MI. Myogenesis in the sea urchin embryo: the molecular fingerprint of the myoblast precursors. Evodevo. 2013 Dec 2;4(1):33. doi: 10.1186/2041-9139-4-33. PubMed PMID: 24295205; PubMed Central PMCID: PMC4175510.
  • Giurato G, De Filippo M.R, Rinaldi A, Hashim A, Nassa G, Ravo M, Rizzo F, Tarallo R, Weisz A. iMir: An Integrated pipeline for high-throughput analysis of small non-coding data obtained by miRNA-Seq. BMC Bioinformatics. 2013 Dec 13;14:362. doi: 10.1186/1471-2105-14-362. PubMed PMID: 24330401; PubMed Central PMCID: PMC3878829.
  • De Filippo M.R, Rizzo F, Marchese G, Giurato G, Nassa G, Ravo M, Tarallo R, Pironti E, Vecchi M, Crichiutti G, Capizzi G, Verrotti A, Weisz A, Coppola G. Lack of pathogenic mutations in six patients with MMPSI. Epilepsy Res. 2014 Feb;108(2):340-4. doi:10.1016/j.eplepsyres.2013.11.007. Epub 2013 Nov 16. PubMed PMID: 24315024.
  • Gentilcore D, Porreca I, Rizzo F, Ganbaatar E, Carchia E, Mallardo M, De Felice M, Ambrosino C. Bisphenol A interferes with thyroid specific gene expression. Toxicology. 2013 Feb 8;304:21-31. doi: 10.1016/j.tox.2012.12.001. Epub 2012 Dec 10. PubMed PMID: 23238275.
  • Ferraro L, Ravo M, Nassa G, Tarallo R, De Filippo MR, Giurato G, Cirillo F, Stellato C, Silvestro S, Cantarella C, Rizzo F, Cimino D, Friard O, Biglia N, De Bortoli M, Cicatiello L, Nola E, Weisz A. Effects of oestrogen on microRNA expression in hormone-responsive breast cancer cells. Horm Cancer. 2012 Jun;3(3):65-78. doi: 10.1007/s12672-012-0102-1. PubMed PMID: 22274890
  • Paris O, Ferraro L, Grober OM, Ravo M, De Filippo MR, Giurato G, Nassa G, Tarallo R, Cantarella C, Rizzo F, Di Benedetto A, Mottolese M, Benes V, Ambrosino C, Nola E, Weisz A. Direct regulation of microRNA biogenesis and expression by estrogen receptor beta in hormone-responsive breast cancer. Oncogene. 2012 Sep 20;31(38):4196-206. doi: 10.1038/onc.2011.583. Epub 2012 Jan 9. PubMed PMID: 22231442
  • Sirakov M, Zarrella I, Borra M, Rizzo F, Biffali E, Arnone MI, Fiorito G. Selection and validation of a set of reliable reference genes for quantitative RT-PCR studies in the brain of the Cephalopod Mollusc Octopus vulgaris. BMC Mol Biol. 2009 Jul 14;10:70. doi: 10.1186/1471-2199-10-70. PubMed PMID: 19602224; PubMed Central PMCID: PMC2722649.
  • Cole AG, Rizzo F, Martinez P, Fernandez-Serra M, Arnone MI. Two ParaHox genes, SpLox and SpCdx, interact to partition the posterior endoderm in the formation of a functional gut. Development. 2009 Feb;136(4):541-9. doi: 10.1242/dev.029959. Epub 2009 Jan 14. PubMed PMID: 19144720.
  • Rizzo F, Fernandez-Serra M, Squarzoni P, Archimandritis A, Arnone MI. Identification and developmental expression of the ets gene family in the sea urchin (Strongylocentrotus purpuratus). Dev Biol. 2006 Dec 1;300(1):35-48. Epub 2006 Aug 10. Review. PubMed PMID: 16997294.
  • Bradham CA, Foltz KR, Beane WS, Arnone MI, Rizzo F, Coffman JA, Mushegian A, Goel M, Morales J, Geneviere AM, Lapraz F, Robertson AJ, Kelkar H, Loza-Coll M, Townley IK, Raisch M, Roux MM, Lepage T, Gache C, McClay DR, Manning G. The sea urchin kinome: a first look. Dev Biol. 2006 Dec 1;300(1):180-93. Epub 2006 Sep 12. PubMed PMID: 17027740.
  • Arnone MI, Rizzo F, Annunciata R, Cameron RA, Peterson KJ, Martínez P. Genetic organization and embryonic expression of the ParaHox genes in the sea urchin S. purpuratus: insights into the relationship between clustering and colinearity. Dev Biol. 2006 Dec 1;300(1):63-73. Epub 2006 Aug 4. PubMed PMID: 16959236.
  • Sea Urchin Genome Sequencing Consortium, Sodergren E, Rizzo F. The genome of the sea urchin Strongylocentrotus purpuratus. Science. 2006 Nov 10;314(5801):941-52. Erratum in: Science. 2007 Feb 9;315(5813):766. PubMed PMID: 17095691; PubMed Central PMCID: PMC3159423.
  • Adinolfi S, Rizzo F, Masino L, Nair M, Martin SR, Pastore A, Temussi PA. Bacterial IscU is a well folded and functional single domain protein. Eur J Biochem. 2004 Jun;271(11):2093-100. PubMed PMID: 15153099.