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LabMedMolGe - Team

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Domenico Giosa


e-mail: dgiosa@unime.it

Laurea in: Biologia cum laude (LM-6), Università degli Studi di Messina. Tesi: “Sequenziamento massivo parallelo dell’intero genoma di Sporothrix pallida”. Supervisor: Prof. Orazio Romeo. (2015)

Dottorato in: Biotecnologie Mediche e Chirurgiche, Dipartimento di Medicina Clinica e Sperimentale, Università degli Studi di Messina (Progetto PON R&I 2014-2020). Supervisor: Prof: Teresa Pollicino. (2017 – in corso)

Competenze ed attività di ricerca: Analisi bioinformatica di dati di Next Generation Sequencing. Assembly di genomi e trascrittomi e conseguente annotazione strutturale e funzionale. Analisi di espressione differenziale. Analisi di varianti somatiche sia da target sequencing che da whole genome sequencing. Studi di popolazione mediante approcci target e whole metagenome shotgun. Analisi filogenetica/filogenomica. Sviluppo di pipeline ad hoc per la caratterizzazione di integrazioni virali nel genoma umano.

Pubblicazioni:

  • Lombardo, D., Saitta, C., Giosa, D., Casuscelli di Tocco, F., Musolino, C., Caminiti, G., Chines, V., Franzè, M. S., Alibrandi, A., Navarra, G., Raimondo, G., Pollicino, T."Frequency of somatic mutations in TERT promoter, TP53 and CTNNB1 genes in patients with hepatocellular carcinoma from Southern Italy". Oncology Letters19.3 (2020): 2368-2374.
  • Nnadi, N.E., Giosa, D., Ayanbimpe, G.M. et al. Whole-Genome Sequencing of an Uncommon Cryptococcus neoformans MLST43 Genotype Isolated in Nigeria. Mycopathologia 184, 555–557 (2019). DOI: 10.1007/s11046-019-00376-1 
  • D'Alessandro, E., Sapienza, I., Giosa, D., Giuffrè, L., & Zumbo, A. (2019). In silico analysis of meat quality candidate genes among Nero Siciliano, and Italian heavy pigs genomes. Large Animal Review, 25(4), 137-140.
  • D'Alessandro E, Giosa D, Sapienza I, Giuffrè L, Cigliano RA, Romeo O, Zumbo A. Whole genome SNPs discovery in Nero Siciliano pig. Genet Mol Biol. 2019;pii: S1415-47572019005021102.
  • D'Aliberti D, Cacciola I, Musolino C, Raffa G, Filomia R, Alibrandi A, Benfatto S, Beninati C, Saitta C, Giosa D, Romeo O, Raimondo G, Pollicino T. NS3 Variability in Hepatitis C Virus Genotype 1A Isolates from Liver Tissue and Serum Samples of Treatment-Naïve Patients with Chronic Hepatitis C. July 2018 Intervirology 61(1):1-8. DOI: 10.1159/000489307
  • Scordino F, Giuffrè L, Barberi G, Marino Merlo F, Orlando MG, Giosa D, Romeo O. Multilocus Sequence Typing Reveals a New Cluster of Closely Related Candida tropicalis Genotypes in Italian Patients With Neurological Disorders. Front. Microbiol., 06 April 2018 https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.00679.
  • Giosa, D., Felice, M. R., Lawrence, T. J., Gulati, M., Scordino, F., Giuffrè, L., Lo Passo, C., D’Alessandro, E., Criseo, G., Ardell, D. H., Hernday, A. D., Nobile, C. J., Romeo, O. (2017). Whole RNA-sequencing and transcriptome assembly of Candida albicans and Candida africana under chlamydospore-inducing conditions. Genome Biology and Evolution, 9(7), 1971-1977.
  • Chowdhary, A., Hagen, F., Sharma, C., Al-Hatmi, A. M. S., Giuffrè, L., Giosa, D., Fan, S., Badali, H., Felice, M. R., de Hoog, S., Meis, J. F., Romeo, O. (2017). Whole Genome-Based Amplified Fragment Length Polymorphism Analysis Reveals Genetic Diversity in Candida africana. Frontiers in microbiology, 3;8:556. doi: 10.3389/fmicb.2017.00556.
  • Huang, L., Gao, W., Giosa, D., Criseo, G., Zhang, J., He, T., Huang, X., Sun, J., Sun, Y., Huang, J., Zhang, Y., Brankovics, B., Scordino, F., D'Alessandro, E., van Diepeningen, A., de Hoog, S., Huang, H., Romeo, O. (2016). Whole-genome sequencing and in silico analysis of two strains of Sporothrix globosa. Genome biology and evolution, 8(11), 3292. doi:10.1093/gbe/evw230.
  • D’Alessandro, E., Giosa, D., Huang, L., Zhang, J., Gao, W., Brankovics, B., Oliveira, M. M. E., Scordino, F., Lo Passo, C., Criseo, G., van Diepeningen, A. D., Huang, H., de Hoog, G. S., Romeo, O. (2016). Draft genome sequence of the dimorphic fungus Sporothrix pallida, a nonpathogenic species belonging to Sporothrix, a genus containing agents of human and feline sporotrichosis. Genome announcements, 4(2), e00184-16. doi:10.1128/genomeA.00184-16.
  • Felice, M. R., Gulati, M., Giuffrè, L., Giosa, D., Di Bella, L. M., Criseo, G., Nobile, C. J., Romeo, O., Scordino, F. (2016) Molecular Characterization of the N-Acetylglucosamine Catabolic Genes in Candida africana, a Natural NAcetylglucosamine Kinase (HXK1) Mutant. PLoS ONE 11(1): e0147902. doi:10.1371/journal.pone.0147902 
  • Rharmitt, S., Hafidi, M., Hajjaj, H., Scordino, F., Giosa, D., Giuffrè, L., Barreca, D., Criseo, G., Romeo, O. (2016). Molecular characterization of patulin producing and non-producing Penicillium species in apples from Morocco. International journal of food microbiology, 217, 137-140. doi:10.1016/j.ijfoodmicro.2015.10.019.